2000年，第二届“大北农科技奖”评审委员会主任由卢良恕院士担任，共计奖励专家20名，奖金人民币70万元，其中中国水产科学院淡水鱼业研究中心研究员夏德全，获得奖励1万元，2001年当选为中国工程院院士；华中农业大学教授陈焕春，获得奖励5万元，随后获得2001年度国家科学技术进步二等奖，2003年当选为中国工程院院士；中国农业科学院郭三堆研究员的申报项目《抗虫棉研制》，获得奖励5万元，此项目后来获2005年度国家科学技术进步二等奖；贵州省油料所侯国佐研究员（双低杂交油菜“油研七号”），获得奖励1万元，两年后获2002年度国家科学技术进步二等奖；中国兽药监察所宁宜宝副研究员（鸡毒支原体病预防技术的研究），获得奖励1万元，四年后获2004年度国家科学技术进步二等奖；中国杂交水稻研究中心罗孝和研究员（“培矮64S”水稻两用核不育系的培育），1999年获得第一届“大北农科技奖”（奖励1万元），2000年获得第二届“大北农科技奖”（奖励5万元），2001年获国家科学技术进步一等奖；江苏省农业科学院邹江石研究员（“两优培九”的育成与生产应用），1999年、2000年获得两届“大北农科技奖” (奖励1万元/奖励5万元），2000年被两院院士评为该年度中国十大科技新闻之首 ，“两优培九”2001年通过国家审定，推广面积约1000万亩，并获得2004年度国家技术发明二等奖。河南省农科院堵纯信研究员（“郑单958”示范推广应用及高产攻关技术研究），2000年获得“大北农科技奖”(奖励5万元)，2000年通过河南、河北、山东及国家审定，在全国累计推广种植面积已达1.35亿亩，2005年种植面积达5500万亩，占全国玉米面积的15％以上，成为建国以来年种植面积最大的玉米品种，也是近年我国年种植面积最大的农作物品种，获2007年度国家科学技术进步二等奖。